非达霉素对原有抗菌药物停用的伪膜性肠炎效果很好。
伪膜性肠炎主要由艰难梭状芽孢杆菌（以下简称艰难梭菌）或难辨梭状芽孢杆菌感染引起，体外试验表明，非达霉素对艰难梭状芽胞杆菌具有杀灭作用，作用机制主要是抑制转录的起始过程，从而抑制RNA的合成。在临床试验中，与万古霉素治疗组的患者相比，更多非达霉素治疗组的患者在治疗结束后持续接受三周非达霉素治疗，并且效果较好。