阿那格雷的作用机制与烷化剂完全不同，也与羟基脲有所区别，安全性较高。临床研究表明，阿那格雷治疗各类型的骨髓增殖性疾病，有利于诱导血小板凝血功能恢复正常化，而羟基脲还不能达到这种治疗作用。
许多指南推荐对血栓形成高危患者进行抗血小板和细胞减灭治疗，特别是，最近修订的欧洲白血病网(ELN)建议推荐羟基脲和干扰素-α作为细胞减灭疗法的一线疗法。如果羟基脲无效或不能耐受，推荐阿那格雷和干扰素-α作为二线治疗。
患者的病情不同，所用的药物不同，具体用阿那格雷还是羟基脲应根据医生对病情的诊断来决定。