阿那莫林的副作用包括有：γ-GTP（血清γ-谷氨酰转肽酶）增加、糖化血红蛋白增加、刺激传导系统抑制、心电图异常、房室传导阻滞、心动过速、心动过缓、心悸、血压下降、上室性期外收缩、高血糖、糖尿病恶化、AST（谷草转氨酶）、ALT（谷丙转氨酶）、ALP（碱性磷酸酶）、γ-GTP（血清γ-谷氨酰转肽酶）、血中胆红素等。因为每位患者的病情进展不同，患者在使用阿那莫林治疗后产生副作用、副作用的严重程度及产生时间也是不同的，其副作用的多与少主要是由患者自身情况决定的。