舒尼替尼最常见的不良反应为疲劳、腹泻、手足综合症、皮肤颜色改变、以及外周性水肿。其他常见的不良反应包括：皮疹、食欲减退、头晕、高血压、上腹痛、以及消化道出血。绝大多数不良反应是1或2级，并且可以通过降低剂量、暂停用药、和/或终止用药得以控制。舒尼替尼治疗胃肠间质瘤和晚期肾细胞癌的推荐剂量是50mg，每日一次，口服；服药4周，停药2周（4/2给药方案）。与食物同服或不同服均可。