依库珠单抗的作用机制是依库珠单抗为重组人源化单克隆IgG2/4κ抗体，是一种末端补体抑制剂，以高亲和力与补体蛋白C5特异性结合，从而抑制C5裂解为C5a和C5b并防止末端补体复合物C5b-9的形成，进而起到治疗阵发性睡眠性血红蛋白尿症（PNH）、非典型溶血尿毒症综合征（aHUS）的作用。
依库珠单抗是互补蛋白C5的单克隆封闭抗体，能够抑制裂解C5a和C5b，从而防止末端补体复合物C5b-9，从而防止RBC溶血，抑制PNH患者的终末补体介导的血管内溶血和aHUS患者的补体介导的血栓性微血管病（TMA） 。