若EGFR仍表现为阳性突变，推荐使用其他替代靶向药物如吉非替尼、奥希替尼、阿法替尼、厄洛替尼。若发生T790M突变，选择奥西替、纳扎替尼治疗。发生其他靶点的基因突变，如HER2、ROS1、ALK等，可以选择对应的靶向药治疗。如果是全身出现孤立病灶：可以考虑局部治疗、继续吉非替尼等药物治疗。
另外，可以检测PD-L1，若检查结果表达阳性(≥50%)时推荐使用派姆单抗治疗。取新病理组织检测，看是否向其他肺癌类型转变，然后选择对应的治疗方式。若患者经受多种治疗方案后无明显受益，可选择最佳支持治疗，减轻患者症状，提高生活质量。若患者在没有确切疗效的标准治疗选择时，可以选择参加临床试验。