1.腹泻
腹泻可能导致脱水和肾衰，阿法替尼对严重和对抗腹泻药物无反应，若长时间腹泻应立即停止阿法替尼。
2.大疱和剥脱性皮肤疾病
可能产生严重大疱，起泡，和去角质病变，对威胁生命的皮肤反应应终止药物治疗，对严重和延长皮肤反应的应停止给药阿法替尼。
3.间质性肺病（ILD）
对肺症状急性发作或恶化的停止给药阿法替尼，确诊ILD的应立即终止阿法替尼。
4.肝毒性
用定期肝检验监视，对肝检验严重或恶化的应停止给药或终止阿法替尼。
5.胚胎胎儿毒性
可致胎儿危害，告知女性及伴侣对胎儿潜在的危害和有效避孕。