泊沙康唑用于预防侵袭性真菌感染：200 mg(5 ml)，每日3次。疗程根据中性粒细胞减少症或免疫抑制的恢复程度而定。
用于口咽念珠菌病：第1天的负荷剂量100 mg(2.5 ml)，每日2次，之后100 mg(2.5 ml)，每日1次，为期13天。
泊沙康唑用于伊曲康唑和/或氟康唑难治性口咽念珠菌病：400 mg(10 ml)，每日2次。疗程根据患者基础疾病的严重程度和临床应答而定。
为了增加泊沙康唑的口服吸收并且优化血浆浓度:1)必须在进餐期间或进餐后立即(20分钟内)服用泊沙康唑。无法进餐的患者，可以伴随营养液或碳酸饮料(如:姜汁汽水)服用泊沙康唑。2)在出现重度腹泻或呕吐的患者中，必须对突破性真菌感染进行密切监测。